Kwisa swój bieg rozpoczyna w Sudetach Zachodnich, płynie przez Pogórze Zachodniosudeckie i Nizinę Śląsko - Łużycką gdzie wpada do Bobru. Posiada źródła na wysokości ok. 1020 m n.p.m. w Górach Izerskich, na południowym - wschodzie od Świeradowa Zdrój. W górnym biegu Kwisa jest typowo górską rzeką, o czym świadczy kamieniste łożysko, głęboko wcięta dolina oraz wahania stanów wody (gwałtowne wezbrania).

Kwisa jest jedną z najczystszych rzek w Polsce, organizowane są na niej spływy kajakowe i pontonowe, jest też dobrą rzeką dla wędkarzy.